مردان ایکس هم اکنون به عنوان قهرمانان عمومی شناخته می شوند و همدردی عمومی نسبت به جهش یافته ها افزایش یافته است. بیشاپ نیز به تیم ملحق شده است و مگنیتو وارث میراث پروفسور ایکس می شود.اما طولی نمی کشد که آنها مانند گذشته به چالش کشیده می‌شوند و مجبور می‌شوند با دشمنی خطرناک و آینده ای غیرمنتظره‌ روبرو شوند.

یک کارآگاه و یک روانکاو در حین تحقیق در مورد گذشته وحشتناک یک زن جوان، شواهدی از یک فرقه شیطانی را کشف می کنند.