داستان فیلم از سال ۱۹۹۰ شروع و در زمان حال به اتمام می‌رسد. و شامل سه فصل می‌شود: فصل اول «شکوفه‌ی گیلاس»، فصل دوم «فضا‌نورد» و فصل سوم «5 سانتی‌متر بر ثانیه» که مجموع این سه فصل دوران بزرگ شدن پسری به نام تاکاکی تونو را نشان می‌دهند و موضوع بیشتر پیرامون احساسات درونی، دغدغه‌ها و برخورد او و انسان‌های پیرامونش با محیط است...

کشور ژاپن پس از جنگ، ویران شده و در ضعیف‌ترین وضعیت خود قرار دارد که یک بحران جدید در قالب یک هیولای غول پیکر و ترسناک پدیدار شده و…

دانشجویان ژاپنی درباره سلسله خودکشی هایی که به یک وبکم اینترنتی مرتبط است تحقیق می کنند.در این وبکم به بازدید کننده ها قول داده می شود که با مرگ روبرو خواهند شد...