زمانیکه دکتر رباتیک با یک متحد جدید بنام ناکلز به زمین برمیگردد. سونیک جوجه تیغی و دوست جدیدش بنام تایلز رو به روی آنها می ایستند تا به اهداف شوم خود دست پیدا نکنند.

پلیسی در شهری کوچک به سونیک کمک می‌کند تا از دست مامورین دولتی که در تعقیبش هستند, فرار کند.