زمانیکه دکتر رباتیک با یک متحد جدید بنام ناکلز به زمین برمیگردد. سونیک جوجه تیغی و دوست جدیدش بنام تایلز رو به روی آنها می ایستند تا به اهداف شوم خود دست پیدا نکنند.