ناروتو، کاکاشی، ساکورا و راک لی برای محافظت از میچیرو، شاهزاده سرزمین ماه برای سفر طولانی‌اش دور دنیا انتخاب شده‌اند و...

چند سال پس از پایان جنگ شینوبی ، بروتو پسر ناروتو تصمیم می گیرد در کنار ساراتا و میتسوکیِ مرموز در آزمون چونین شرکت کند. اما…

نینجاها در سرتاسر تمام کشورها ناپدید میشوند و همه ملت آتش رو مقصر میدانند. به دستور سوناده، کاکاشی قربانی میشود تا جلوی جنگی همه جانبه گرفته شود....

روح قدرتمندی که زمانی جهان را تهدید به نابودی می کرد، بازگشته است! ماموریت ناروتو محافظت از یک کشیش به نام شیون است که تنها کسی است که می تواند هیولا را مهر و موم کند.